داستان بازي داستان شخصيتي است به نام Alex Mercer که توسط دولت به يک انسان جهش يافته تبديل شده است.ولي پس از بهوش آمدن حافظه او به کلي پاک شده و هيچ چيز به ياد نمي آورد.در prototype بازيباز کشف ميکند که علاوه بر خود او دولت ويروسي خلق کرده که به پيدايش جهش يافتگان ((mutant منجر شده است.هيولاهايي مرگبار و وحشي که حتي ابر قهرماني چون الکس هم بايد از دست شان قرار کند.اين موجودات آلوده شده infected ويروس را در محلات گوناگون پخش کرده و جمعيت نيويورک را به زامبي و هيولا تبديل مي کنند.دولت براي مقابله با مخلوقات خود ساخته اش, گروهي به نام black watch به شهر اعزام کرده است.اعضاي بلک واچ براي مقابله با بحران هايي چون گسترش ويروس جهش يافتگي , تعليم ديده و هيچ گونه رحم و گذشتي از خود بروز نمي دهند.شما در ابتداي داستان حافظه خود را از دست داده ايد تا اينکه در همان مراحل ابتدايي خواهر خود را به ياد مي آوريد و به سراغش مي رويد. و در حقيقت او محل ماموريتهاي شما(محلهاي پخش شدن ويروس) را به شما ميگويد.در اواسط بازي شما با يک دکتر آشنا ميشويد که به کمک آن پادزهر  اين ويروس را پيدا کرده و وظيفه داريد آن را در شهر پخش کنيد.سر انجام در مراحل آخر بازي که يکي از سخترين مراحل بازي هم هست شما موجود غول آسايي به نام elizabeteh green را نابود ميکنيد و به کمک يک ماشين مکانيکي مخزنهاي پادزهر را به زير زمين و منابع آلودگي ميفرستيد.و در آخر هم موفق به پاکسازي آلودگي نميشويد.نکته جالب اين است که تمامي افراد موجود در بازي از جمله فرماندهان ارتش و گروه black watch سر انجام به هيولاهاي غير قابل کنترل تبديل مي شوند و شما وظيفه مبارزه با آنها را داريد. در حقيقت شما در يک جبهه سه جانبه قرار داريد هم با گروه black watch مبارزه ميکنيد و هم با موجودات آلوده و زامبي ها و 2 جبهه ديگر نيز به همين صورت.در ابتداي بازي شما در هجدهمين روزي قرار داريد که تقريبا نيويورک به يک جهنم واقعي تبديل شده است.در اين مرحله که انتهاي بازي در اول بازي تا دقايقي روايت ميشود شما تقريبا تمامي توانايي هاي الکس را تا دقايقي دارا هستيد و سرانجام بازي از روز اول شروع ميشود که شما هيچ قابليتي نداريد.

گيم پلي بازي واقعا سرگرم کننده است.آزادي عمل واقعا براي يک بازي نقش آفريني کامل و بدون نقص است شما ميتوانيد اتومبيلها يا ساير اجسام را بلند کرده و به سمت هدف پرتاب کنيد سوار تانکهاي مختلف شويد هلي کوپتر ها را در هوا يا روي زمين بدزديد و کنترل کنيد لازم به ذکر است که در هلي کوپترها و تانکها هم تنوع نسبتا کم ولي قابل قبولي وجود دارد.مانند بازي gta امکان شليک با تانک و هلي کوپتر و بهم ريختن شهر را داريد.هر مرحله اي از بازي به خواست شما ميتواند با يکي از روشهاي ژنتيکي خود الکس يا وسايل نقليه يا اسلحه هاي نظاميان و black watch ها تمام شود.بله...شما ميتوانيد از اسلحه ي نظاميان هم استفاده کنيد و در محلهاي شلوغ اين مي تواند بهترين گزينه باشد. تنوع اسلحه ها هم نسبتا خوب است و شما به يک موشک انداز و يک نارنجک انداز هم در حين بازي دسترسي داريد.بريم به سراغ قابليتهاي ژنتيکي خود الکس که بتدريج در مراحل مختلف بازي امکان خريداري کردن آنها پيدا کرده و ميتوانيد مرحله جديد را با قابليتهاي جديد شروع کنيد.(در ابتداي بعضي مراحل آنلاک کردن برخي از قابليتها الزامي است).قابليت تشخيص فرماندهان دشمن و همچنين ساير افراد, با خريداري اين قابليت شما ميتوانيد فرماندهان اصلي نظاميان و حتي افراد معمولي به راحتي از هم تشخيص و جدا کنيد(ويژه مناطق شلوغ).دومين قابليت امکان استفاده از سپر محافظ است که با بکارگيري آن و ميتوانيد هر مانعي که جلويتان باشد را از سر راه برداريد.و ديگري يک لباس آهني (armor) هست که شما ميتونيد با پوشيدن آن توانايي سلامتي خود را دو چندان کنيد البته در اين حالت قابليت پرواز ديگر وجود ندارد( به دليل سنگين شدن الکس).و بخش سوم که توانايي هاي ژنتيکي و قابليتهاي جنگ و درگيري الکس است.اولين قابليت قابليت مشت آهني است که با فعال کردن آن مشت شما به يک مشت بزرگ و آهني تبديل ميشود که با کمک آن ميتوانيد همه چيز را له کنيد(من شخصا عاشق اين بخش بازي بودم) مثلا بازدن کليد سمت چپ يک نوع حمله و با پرش و زدن کليک سمت راست ميتوانيد هر چيزي را له کنيد اين کاربرد در محلهاي شلوغ واقعا لذت بخش است وقتي که به ميان مردم فرود مي آييد و هر کاراکتري به سمتي پرتاب ميشود واقعا لذت بخش است.حتي وقتي که از بالاي يک آسمان خراش بر سر يک هلي کوپتر بيچاره با اين مشت فرود مي آييد فکر نميکنم دوست داشته باشيد بقيه ماجرا را بشنويد.....همچنين با گرفتن کليک سمت چپ و راست ماوس با هم 2 ضربه پياپي به زمين زده ميشود که موجب پرتاب شدن هرچيزي که تا شعاع 10 متري شما وجود دارد به اطراف ميشود.قابليت ديگر بازوي قدرتمند شما که براي درگيري هاي نزديک و همچنين ميتونيد اجسام سنگين را تا برد بيشتر پرتاب کنيد.قابليت ديگر يک بازوي شلاق مانند است که بوسيله آن ميتوانيد از فاصله ي دور موجودات و زامبي ها را هدف قرار دهيد يا به هلي کوپترهاي موجود در هوا با کليک سمت راست ضربه سنگين وارد کنيد.قابليت ديگر تيغه موجود در دستان الکس است که به کمک آن ميتوانيد دشمنان را تيکه تيکه کنيد.همچنين يک تيغ بزرگ هم از قابليتهاي ديگر الکس است که ميتوانيد به کمک آن دشمنان را دو شقه کنيد.و يا با يک ضربه هيولاها را نابود کنيد(با پرش و ضربه عمودي).چيزي که از همه بيشتر آزار دهنده است وجود super soldiers هاي غير منطقي در طول اواسط تا اواخر بازيست که قدرتي تقريبا چند برابر هيولاها دارند و گلوله ي تانک هم نابودشان نميکند و خيلي غير منطقي و بلند پروازانه و البته اعصاب خرد کن است.

فيزيک بازي در حد مطلوبي قرار دارد محيطهاي شلوغ بازي و پر از جمعيت بدون کاهش فريم ريت و امکان نابود کردن مردم واکنش مردم در برابر انفجار و يا نصف شدن زامبي ها با تيغه ي بزرگ الکس عالي شبيه سازي شده.rigid body کاراکترها در حد قابل قبولي است ولي عالي نيست.همچنين collision detection مناسبي در بازي وجود دارد و بسيار کار آمد و راضي کننده است.افکتهاي multi texturing بسيار بد کار شده اند(روي ساختمانهاي آلوده کاملا مي توان اين ضعف را ديد).همچنين انفجار بازي اصلا خوب شبيه سازي نشده است.از بخش ديگر گيم پلي بازي مي توان به پرش هاي بلند دويدن روي ديوارهاي بلند و آسمان خراشها و پرواز بر فراز نيويورک اشاره کرد.که البته در اين بخش view distance بازي خودي نشان ميدهد ولي اين محيط sand box بزرگ دچار يک گرافيک ناشيانه است.البته با وجود قابليت تخريب پذيري که در کل سطح شهر وجود دارد شايد کسي انتظار گرافيکي مطلوب در حد gta iv را نداشته باشد ولي ساختمانها بيشتر شبيه به مکعبهاي توخالي و مقوايي هستند تا ساختمان.گرافيک هنري بازي هم از هر نظر ايراد دارد و  بسيار ناشيانه کار شده و نميتواند به صورت کامل حال و هواي شهر را به گيمر انتقال دهد.گاهي برخي مراحل انقدر سخت هستند که بايد ساعتهاي براي عبور از آن وقت بگذاريد(در حالت آسان بازي).همچنين الکس ميتواند با مشت زدن به  زمين تيغ هاي برنده اي را از زمين بيرون بياورد که نه تنها زامبي ها و هيولاها و بلکه اتومبيلها هم به سيخ کشيده ميشوند. و هچنين يک قابليت ديگر که در حقيقت در يک لحظه ميتوانيد از شر همه خلاص شويد بازواني هستند که از بدن الکس بيرون مي آيند(چيزي شبيه به  بازوي شلاغي مانند nemesis غول resident evil3 ) که در بدن تمامي دشمنان موجود در ناحيه اي که شما قرار داريد فرو ميروند و همه چيز را ميشکافند تنها چيزي که بعد از اين عمل در محيط حرکت ميکند وسايل نقليه است.(تمامي دشمنان از قبيل هيولاها , نظامي ها , زامبي ها ) نابود ميشوند.

از قابليت هاي الکس اين است که ميتواند به شکل ديگران تبديل شود.شما هر شخصي را که بخواهيد مي توانيد نابود کنيد و آن را در حقيقت مصرف(consume) کنيد خاطرات آن را مرور کنيد و به راحتي به شکل آن در آييد اين کاربرد در حالي که مراحل مخفي کاري انجام مي دهيد و يا زماني که در حال فرار کردن از دست گروههاي black watch هستيد ميتوانيد شکل خود را تغيير دهيد.هوش مصنوعي در برخي موارد باگهايي دارد البته نميتوان آن را باگ هم محسوب کرد.همانطور که در ابتداي اين نفد گفته شد بازي يه جبهه 3 جانبه دارد پس طبيعي است که در يک صحنه هيولاها کشتن گروهاي نظامي را به مبارزه با شما ترجيح دهند يا برعکس.

در کل بازي prototype يک ايده بزرگ بود که تا حدودي به نتيجه رسيد ولي گرافيک بسيار کم قدرت و روايت بد داستان بازي در کنار اين گيم پلي جذاب اصلا قابل بخشش نيست.

نویسنده:آرش.